Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip2Q9Z0H8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip2Q9Z0H8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms