Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin2Q9WVE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin2Q9WVE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin2Q9WVE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin2Q9WVE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacsin2Q9WVE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.2 ms