Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slit3Q9WVB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slit3Q9WVB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slit3Q9WVB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Slit3Q9WVB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slit3Q9WVB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slit3Q9WVB4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit3Q9WVB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms