Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1a4Q9WV27 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a4Q9WV27 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms