Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uchl5Q9WUP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl5Q9WUP7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms