Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scnn1bQ9WU38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scnn1bQ9WU38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scnn1bQ9WU38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms