Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax2Q9WTP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax2Q9WTP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms