Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ggps1Q9WTN0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggps1Q9WTN0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms