Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc2Q9R244 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc2Q9R244 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc2Q9R244 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms