Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc6Q9R1S7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc6Q9R1S7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc6Q9R1S7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms