Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chst4Q9R1I1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chst4Q9R1I1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms