Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ntn3Q9R1A3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ntn3Q9R1A3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ntn3Q9R1A3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms