Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed2Q9R0Q3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed2Q9R0Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed2Q9R0Q3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms