Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek3Q9R0A5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek3Q9R0A5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms