Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhl3Q9R059 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms