Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg1Q9QZE5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg1Q9QZE5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms