Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc4Q9QZD4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc4Q9QZD4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc4Q9QZD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms