Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tomm40Q9QYA2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tomm40Q9QYA2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms