Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan3Q9QY33 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tspan3Q9QY33 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan3Q9QY33 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tspan3Q9QY33 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tspan3Q9QY33 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tspan3Q9QY33 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan3Q9QY33 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms