Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snai3Q9QY31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snai3Q9QY31 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snai3Q9QY31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snai3Q9QY31 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snai3Q9QY31 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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