Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Opn4Q9QXZ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms