Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nufip1Q9QXX8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nufip1Q9QXX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nufip1Q9QXX8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms