Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc7a8Q9QXW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc7a8Q9QXW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc7a8Q9QXW9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc7a8Q9QXW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms