Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copg2Q9QXK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copg2Q9QXK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms