Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmQ9QXG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ChmQ9QXG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms