Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms