Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rai2Q9QVY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms