Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cln8Q9QUK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln8Q9QUK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms