Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaja4Q9JMC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja4Q9JMC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms