Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Reep6Q9JM62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms