Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cul3Q9JLV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul3Q9JLV5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms