Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cabp1Q9JLK7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cabp1Q9JLK7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cabp1Q9JLK7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cabp1Q9JLK7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms