Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr5Q9JLF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr5Q9JLF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms