Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msrb1Q9JLC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msrb1Q9JLC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms