Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prg3Q9JL95 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prg3Q9JL95 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms