Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gde1Q9JL56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms