Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx5Q9JKQ4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx5Q9JKQ4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx5Q9JKQ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms