Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod2Q9JKK7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod2Q9JKK7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod2Q9JKK7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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