Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ap3m1Q9JKC8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms