Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PigbQ9JJQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PigbQ9JJQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PigbQ9JJQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms