Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms