Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FliiQ9JJ28 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FliiQ9JJ28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms