Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1fQ9JIS7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1fQ9JIS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms