Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copb1Q9JIF7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copb1Q9JIF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Copb1Q9JIF7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms