Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl1Q9JI74 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl1Q9JI74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms