Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2ird1Q9JI57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2ird1Q9JI57 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms