Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3r2Q9JHL1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3r2Q9JHL1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms