Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RabggtaQ9JHK4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RabggtaQ9JHK4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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