Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms