Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timp4Q9JHB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timp4Q9JHB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timp4Q9JHB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timp4Q9JHB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Timp4Q9JHB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timp4Q9JHB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timp4Q9JHB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms